В общем мне удалось подобрать способ. Он конечно потребует от вас определенных затрат труда, но зато работает, и на выходе получаются нормального качество pdf-ки.

Для начала вам понадобится виртуальный pdf-принтер. Можно использовать любой, но я бы порекомендовал PDFCreator. Скачайте и установите его (ссылку найдете ниже), после этого у вас в системе появится принтер с соответствующим названием. Все что отправляется на него печататься, в конечном счете сохраняется в pdf-файл.

Теперь самое интересное. Если просто перейти по предоставленным вами ссылкам, мы действительно увидим, что документы там находящиеся нельзя ни сохранить ни распечатать. Однако, если к этим ссылкам в конце приписать "/?mode=embed" и опять таки перейти по ним, документ откроется в специальном просмотрщике, где среди прочих будет и возможность печати. Ей то вы и воспользуетесь.

Алгоритм будет следующий: переходите по модифицированной ссылке (снизу найдете готовые), выбираете страницу с которой планируете начать сохранение и жмете на кнопку с принтером на панели сверху. В выпадающем меню где спрашивается какие страницы вы хотите печатать, по возможности выбирайте обе (Both Page, на первой и последней страницах эта опция по понятным причинам не доступна). Затем откроется уже системное окно с выбором принтера, где вам нужно выбрать PDFCreator и запустить печать. В появившемся окне PDFCreator'а, нужно будет нажать кнопку Собрать/Подождать. После этого вы проделываете то же самое со всеми следующими страницами документа, правда теперь окно PDFCreator'а уже не будет появляться каждый раз, он свернется в трей и будет копить все посылаемые на него страницы.

Когда все нужные страницы будут отправлены на печать, разворачиваем PDFCreator из трея, жмем на кнопку Объединить все, дожидаемся объединения и затем жмем на самую первую кнопку с принтером. После чего видим уже знакомое окно, где на это раз выбираем Сохранить.
Вуаля, вы получаете то что хотели.

p.s. Процессы объединения страниц, а так же собственно сохранения в pdf-файл достаточно ресурсоемки. Если у вас слабый компьютер, объединение всех страниц за раз даться ему с очень большим трудом, если вообще дастся. Поэтому в этом случае рекомендуется делать объединение периодически, по накоплении 5-10 страниц.
Так же, пока страницы копятся, они хранятся в полусыром, несжатом виде и могут занимать довольно много места на диске. Перед тем как начать, убедитесь, что места на нем достаточно.