Форум Химиков - Энтузиастов. Химия и Химики
http://chemistry-chemists.com/forum/

Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
http://chemistry-chemists.com/forum/viewtopic.php?f=61&t=3492		 Page 2 of 8
Author:  Dorif [ 26 Aug 2012 21:29 ]
Post subject:  Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
caissonlabs.com - можно заказать бесплатные образцы всего ассортимента продукции. Меня интересовали агар и LB среда. Всё пришло: 2 пакетика агара по 9 грамм, 1 пакеик для приготовления литра жидкой и один - для литра твёрдой среды. Организацию указывать не обязательно: вам просто пишет на емейл их представитель и спрашивает адрес и чем вы занимаетесь. Вот собственно и всё - просто, быстро, надёжно.
Author:  Pitman [ 24 Sep 2012 21:03 ]
Post subject:  Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
Анимация на буржуйском языке по теме репликация ДНК.
http://www.wiley.com/college/pratt/0471393878/student/animations/dna_replication/index.html
Author:  Антон [ 26 Sep 2012 12:35 ]
Post subject:  Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
Pitman wrote:
Анимация на буржуйском языке по теме репликация ДНК.
http://www.wiley.com/college/pratt/0471393878/student/animations/dna_replication/index.html


Очень долго искал обычную gif-анимацию репликации ДНК, но так не нашёл, жаль.
Author:  Alonerover [ 22 Feb 2013 22:50 ]
Post subject:  Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
Народ - кто как решает проблему с приобретением рестриктаз и лигаз? Суда по литературе самому получать их достаточно долгий и муторный процесс, к тому же без гарантии положительного результата..
Author:  labx [ 23 Feb 2013 03:03 ]
Post subject:  Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
покупаю, другой варианта отсутствует. самому трудоемко много реактивов, оборудование, ну и выход небольшой . покупал тут ( сейчас не знаю продают ли частникам) http://www.helicon.ru/catalog/section.p ... ION_ID=278
хорошая тема трансгены на дому_
Author:  Alonerover [ 23 Feb 2013 15:23 ]
Post subject:  Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
Спасибо за оперативный ответ и за ссылку!

Будем разбираться в их номенклатуре, что конкретно под поставленные задачи подходит..
Author:  Bi [ 23 Feb 2013 16:28 ]
Post subject:  Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
Мне попался интересный сайт с моделями http://visualscience.ru/ .
Там есть 3d модели вирусов.
Author:  Alonerover [ 04 Mar 2013 22:45 ]
Post subject:  Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
В процессе освоения темы возник вопрос - если с алгоритмом выбора рестриктаз всё более менее понятно (выбирается под конкретную задачу-плазмиду), то с лигазами вопрос не разрешается: они универсальны и способны сшивать любые липкие концы или здесь тоже есть своя хитрость?
Author:  Triumfator [ 05 Mar 2013 00:32 ]
Post subject:  Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
Dorif wrote:
caissonlabs.com - можно заказать бесплатные образцы всего ассортимента продукции. Меня интересовали агар и LB среда. Всё пришло: 2 пакетика агара по 9 грамм, 1 пакеик для приготовления литра жидкой и один - для литра твёрдой среды. Организацию указывать не обязательно: вам просто пишет на емейл их представитель и спрашивает адрес и чем вы занимаетесь. Вот собственно и всё - просто, быстро, надёжно.

А как там заказать бесплатные образцы? И если я школьник, что мне им написать, когда будут спрашивать-чем занимаетесь?
Author:  Dorif [ 06 Mar 2013 00:34 ]
Post subject:  Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
Triumfator wrote:
Dorif wrote:
caissonlabs.com - можно заказать бесплатные образцы всего ассортимента продукции. Меня интересовали агар и LB среда. Всё пришло: 2 пакетика агара по 9 грамм, 1 пакеик для приготовления литра жидкой и один - для литра твёрдой среды. Организацию указывать не обязательно: вам просто пишет на емейл их представитель и спрашивает адрес и чем вы занимаетесь. Вот собственно и всё - просто, быстро, надёжно.

А как там заказать бесплатные образцы? И если я школьник, что мне им написать, когда будут спрашивать-чем занимаетесь?

Найдите интересующий вас продукт. Сбоку будет баннер
Quote:
NOW YOU CAN
TRY IT
BEFORE YOU
BUY IT

Под баннером - форма для данных. Заполните её и нажмите кнопку Request Sample. Ждите емейл. Отвечайте честно - они терпеть не могут вранья. Пишите, что школьник, что делаете школьный проект(на всякий случай - сделайте реально школьный проект - и интересно, и познавательно, и для оценки по биологии и химии полезно), что ищите, у кого можно дёшево брать компоненты для сред. У них реально дёшево. Они пришлют немножечко на пробу того, что заказывали и могут что-то ещё приятное положить. Пробнички у них классные - после этого реально захочется купить, благо там, как я уже сказал - недорого.

Что классного в американских компаниях - они ответственно подходят к своему делу и чаще всего поддерживают энтузиастов.
Author:  Tigtinc [ 11 Mar 2013 06:04 ]
Post subject:  Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
Quote:
Кстати, нашёл где достать бесплатные образцы плазмид для опытов с E. coli: http://www.aldevron.com/products/dnas/plasmids/ Заказал. Мне вот сейчас пришли образцы pRc/CMV-Hbs(S) и pCMVHB-S2.S.

К сожалению, поле заполнения формы выдаёт ошибку.
Кому-то в последнее время удавалось раздобыть у них плазмиды?

Quote:
По большому счету, в научных исследованиях у себя дома нет ничего экстраординарного.

Более того, в ближайшем будущем биотехнология начнет входить как хобби в массы аналогично радиолюбительству когда-то.
А компании просто мечтают, чтоб поскорее это произошло, так как рынок увеличится многократно, и максимально этому способствуют.
В продаже уже полно наборов “юный генетик”
Quote:
Одно плохо: не знаю, где буферы Гуда взять

Да в любой химфирме под заказ.
тут есть трисы например.
http://www.yugsintez.dp.ua (сайт иногда глючит)
Также не стоит из Америки заказывать питательные среды.
Агар для сред можно взять пищевой на любой фирме
http://ingredient.com.ua/agar.html вот тут примерно 120 грн/кг
и составлять любые среды на свое усмотрение.
Из практики на таком агаре отлично растут бактерии, грибы, растения.
Author:  labx [ 17 Mar 2013 01:44 ]
Post subject:  Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
Наконец купил амплификатор.

Амплификатор — прибор, обеспечивающий периодическое охлаждение и нагревание пробирок, обычно с точностью не менее 0,1 °C и необходимый для проведения полимеразной цепной реакции. Амплификатор используется в молекулярной биологии для амплификации ДНК методом полимеразной цепной реакции.

Attachments:
IMG_0435.JPG
IMG_0435.JPG [ 1.31 MiB | Viewed 15143 times ]
File comment: Techgene OPERATOR’S MANUAL
techne_techgene-76472.pdf [275.31 KiB]
Downloaded 582 times
Author:  Tigtinc [ 28 Apr 2013 20:44 ]
Post subject:  Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
Quote:
Меня интересовали агар и LB среда. Всё пришло: 2 пакетика агара по 9 грамм, 1 пакеик для приготовления литра жидкой и один - для литра твёрдой среды.

Так у них там агароза для фореза.
И как она себя показала?

Заказал у них линейки, уже пришли.


http://cheapassscience.wordpress.com/category/gels/
немного по бюджетным буферам и гелям.
особенно камера для фореза из лего порадовала)
Author:  Tigtinc [ 05 Jun 2013 21:15 ]
Post subject:  Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
GFP
Карта плазмиды в pdf

В первой чашке посев получился слишком плотный, потому фоткал без крышки.

Attachments:
File comment: GfpMaps
GfpMaps.pdf [12.96 KiB]
Downloaded 512 times
File comment: GFP
gfp-2.jpg
gfp-2.jpg [ 250.48 KiB | Viewed 15002 times ]
File comment: GFP
IMG_1655.JPG
IMG_1655.JPG [ 3.78 MiB | Viewed 15002 times ]
Author:  Dorif [ 25 Jan 2014 18:47 ]
Post subject:  Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
Вопрос: ДНК при pH 4,7 - 4,8 (оптимум активности имеющейся протеазы) достаточно стабильна? Протеаза для очистки от белков юзается.

Спасибо!
Author:  Upsidesium [ 25 Jan 2014 20:39 ]
Post subject:  Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
Dorif wrote:
Вопрос: ДНК при pH 4,7 - 4,8 (оптимум активности имеющейся протеазы) достаточно стабильна? Протеаза для очистки от белков юзается.

Спасибо!

Возможность протонирования амино- и имино- групп, участвующих в образовании водородных связей между комплементарными основаниями ДНК, объясняет различные стабильности ДНК в зависимости от рН раствора. Эта зависимость колоколообразная, и ДНК наиболее стабильна при pH ≤ 7 . Для разбавления ДНК используется цитратный буферный раствор. Сокращенно обозначаемыйSSC. Раствор 0,1 SSC содержит 0,15 М NaCl и 0,015 M трехзамещенного лимонного натрия.
Концентрация катионов Na в таком растворе составляет 0,195 М.
Author:  Dorif [ 29 Jan 2014 22:03 ]
Post subject:  Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
Интересный вопрос: в плазмидах, экспрессирующих свои гены в клетках млекопитающих участок начала репликации в клетках млекопитающих где расположен? Участок начала репликации в бактериальных клетках, как правило представляет собой отдельную открытую рамку считывания, но для репликации в клетках млекопитающих ничего подобного не нашёл.

Этот участок начала репликации может внутри промотора находиться? Например - внутри промотора цитомегаловируса в плазмидах pCMV-S, pCMVHB-S2.S. Карта pCMV-S ниже. Бледным сине-зелёным цветом выделен промотор цитомегаловирусный, красным - участок начала репликации pUC, насыщенным зелёным - ColE1.

Attachments:
pCMV-S map.png
pCMV-S map.png [ 3.1 MiB | Viewed 14605 times ]
Author:  Dorif [ 29 Jan 2014 23:22 ]
Post subject:  Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
Переформулирую.

Есть вот плазмиды pCMV-S и pCMVHB-S2.S. Для репликации в бактериях у них есть участок начала репликации pUC ori. А как они в клетках млекопитающих реплицируются? Ведь они нацелены как раз на работу в клетках млекопитающих(гены белков вируса гепатита Б, которые предполагается экспрессировать, находятся под контролем цитомегаловирусного промотора). Но ничего похожего на участок начала репликации в эукариотных клетках я не вижу.
Author:  Upsidesium [ 30 Jan 2014 10:23 ]
Post subject:  Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
Во всей литературе которую встречал сказано, что механизм до конца не изучен. Причем в разных клетках репликация идет по разному, что дает основания полагать об использовании комформаций и др структурных особенностей ДНК.
Author:  Dorif [ 27 Feb 2014 18:32 ]
Post subject:  Re: Биохакеры: молекулярная биология в стиле «сделай сам»
Вопрос: если в методиках, по которым нужен ПЭГ 6000 использовать ПЭГ 1500(есть только он у меня) - что изменится от этого? Спасибо!
Page 2 of 8 All times are UTC [ DST ]
Powered by phpBB © 2000, 2002, 2005, 2007 phpBB Group
http://www.phpbb.com/