Форум Химиков - Энтузиастов. Химия и Химики
http://chemistry-chemists.com/forum/

Генетика и ГМО
http://chemistry-chemists.com/forum/viewtopic.php?f=61&t=1616		 Page 13 of 14
Author:  Ramon [ 22 Feb 2021 19:40 ]
Post subject:  Re: Генетика и ГМО
Gilgamesh wrote:
И неужели современная наука не в состоянии решать эту проблему? Это так сложно?

Очень сложно. Даже сама природа за 4 млрд. лет не смогла решить эту проблему. Старение это следствие накопления подобных ошибок в новых поколениях клеток. Сюда же наследственные заболевания. Даже эволюция это тоже следствие подобных ошибок (отрицательный и положительный отбор).
А Вы требуете от ученых решения данной проблемы за пару десятков лет. Да еще и in vitro.
Author:  Gilgamesh [ 24 Feb 2021 19:46 ]
Post subject:  Re: Генетика и ГМО
У меня вот такие вопросы насчет генной инженерии:
1) Допустим что мы хотим пересадить в эукариоте (например в обезьяну) какие-то гены. Сколько ген можно пересадить? Один? Два? Можно вот сразу 20 гена пересадить?
2) Можно одновременно и пересадить гены и удалить какие-то другие гены которые уже есть в организме но мы не хотим чтоб их там было?
3) Имеет ли какое-то значение в каких хромосомах (у обезьяны их 48) будет доставлен эти гены? Это можно вообще как-то контролировать?

Ramon
Quote:
А Вы требуете от ученых решения данной проблемы за пару десятков лет. Да еще и in vitro.

А нет каких-либо других путей для быстрого синтеза ДНК кроме той которого используют в тех машинах?
Author:  Upsidesium [ 24 Feb 2021 20:44 ]
Post subject:  Re: Генетика и ГМО
Gilgamesh wrote:
1) Допустим что мы хотим пересадить в эукариоте (например в обезьяну) какие-то гены. Сколько ген можно пересадить? Один? Два? Можно вот сразу 20 гена пересадить?

Можно скрестить геномы - гаплоидный (50% генов) набор от двух разных видов. У растений можно пойти еще дальше и получить амфидиплоиды - организм содержащий два диплоидных (100% генов) набора от двух видов.
Gilgamesh wrote:
2) Можно одновременно и пересадить гены и удалить какие-то другие гены которые уже есть в организме но мы не хотим чтоб их там было?
3) Имеет ли какое-то значение в каких хромосомах (у обезьяны их 48) будет доставлен эти гены? Это можно вообще как-то контролировать?

Конечно можно удалить. А вот с вставкой пока проблемы. Нет методов которые бы контролировали точность этой вставки. Как только проблема будет решена, то редактирование генома станет такой же обыденностью как и пластические операции.
Эффект положения гена в хромосоме (эффект Стертеванта) имеет место быть. Наблюдается он и в природе, например, при структурных перестройках хромосом (транслокациях), в результате которых гены активных зон хромосом (эухроматин) могут переноситься в неактивные зоны (гетерохроматин) и инактивироваться и наоборот. При перестройке, возвращающей эухроматиновый ген из гетерохроматина в любую точку эухроматина, функционирование данного гена восстанавливается. Явление обратимое, в отличие от мутации.
Gilgamesh wrote:
А нет каких-либо других путей для быстрого синтеза ДНК кроме той которого используют в тех машинах?

Кинетические ограничения. Можно увеличить скорость, но при этом потерять всю селективность.
Author:  Gilgamesh [ 26 Feb 2021 18:54 ]
Post subject:  Re: Генетика и ГМО
Upsidesium
Quote:
Можно скрестить геномы - гаплоидный (50% генов) набор от двух разных видов. У растений можно пойти еще дальше и получить амфидиплоиды - организм содержащий два диплоидных (100% генов) набора от двух видов.

Ого! Так много? Значит можно например в плазмидах поместить скажем 20 ген и сразу внести их в геном обезьяны?

Quote:
А вот с вставкой пока проблемы. Нет методов которые бы контролировали точность этой вставки

Quote:
Эффект положения гена в хромосоме (эффект Стертеванта) имеет место быть.

Quote:
гены активных зон хромосом (эухроматин) могут переноситься в неактивные зоны (гетерохроматин) и инактивироваться и наоборот. При перестройке, возвращающей эухроматиновый ген из гетерохроматина в любую точку эухроматина, функционирование данного гена восстанавливается. Явление обратимое, в отличие от мутации

Ну допустим что мы хотим пересадить скажем 20 ген в обезьяну и все попали в эухроматин. Вот имеет ли значение в каких хромосомах они будут доставлены? Если имеет то как их контролируют? Ведь пересаживают гены, значить контроль должно быть.
Author:  Upsidesium [ 27 Feb 2021 01:03 ]
Post subject:  Re: Генетика и ГМО
Gilgamesh wrote:
Ого! Так много? Значит можно например в плазмидах поместить скажем 20 ген и сразу внести их в геном обезьяны?

Можно.
Gilgamesh wrote:
Ну допустим что мы хотим пересадить скажем 20 ген в обезьяну и все попали в эухроматин. Вот имеет ли значение в каких хромосомах они будут доставлены? Если имеет то как их контролируют? Ведь пересаживают гены, значить контроль должно быть.

Никуда они не попали. Клетка сама решает куда их вставить и вставить ли вообще. Делается это следующим образом. Путем трансфекции, например, с помощью липосом плазмиды или даже artifical chromosome вводится в цитоплазму клетки и далее проникает в ядро. Обработанная культура клеток выдерживается 2-3 сут на неселективной питательной среде, а затем пересеваются на селективную, на которой исходные клетки не растут (т.к., скажем, в гене который мы ввели закодирован синтез фермента необходимого для расщепления субстрата селективной среды). Выросшие трансфекцированные культуры затем культивируют и размножают на обычных средах. Вот и весь контроль.
Author:  Gilgamesh [ 01 Mar 2021 20:23 ]
Post subject:  Re: Генетика и ГМО
Upsidesium
Quote:
Можно

Очень хорошо
Quote:
Никуда они не попали. Клетка сама решает куда их вставить и вставить ли вообще. Делается это следующим образом. Путем трансфекции, например, с помощью липосом плазмиды или даже artifical chromosome вводится в цитоплазму клетки и далее проникает в ядро. Обработанная культура клеток выдерживается 2-3 сут на неселективной питательной среде, а затем пересеваются на селективную, на которой исходные клетки не растут (т.к., скажем, в гене который мы ввели закодирован синтез фермента необходимого для расщепления субстрата селективной среды). Выросшие трансфекцированные культуры затем культивируют и размножают на обычных средах. Вот и весь контроль.

Спасибо, понятно, но:
Quote:
даже artifical chromosome

А как его делают? Ведь искусственная хромосома должен быть довольно длинной, а собрать его из 20-20 нуклеотидов требует слишком много времени? Или существует другой путь?
Author:  Upsidesium [ 01 Mar 2021 21:18 ]
Post subject:  Re: Генетика и ГМО
Gilgamesh wrote:
А как его делают? Ведь искусственная хромосома должен быть довольно длинной, а собрать его из 20-20 нуклеотидов требует слишком много времени? Или существует другой путь?

В данный момент существуют две общепринятые модели создания искусственных хромосом:
1) Создание минихромосомы путем изменения естественной хромосомы. Это достигается путем усечения естественной хромосомы с последующим введением уникального генетического материала через систему рекомбинации Cre-Lox.
2) Создание новой хромосомы de novo (можно сказать, что синтетической). Но прогресс в отношении образования de novo ИХ пока ограничен, так как многие крупные геномные фрагменты не могут успешно интегрироваться в векторы de novo. Еще одним фактором, ограничивающим формирование вектора de novo, является ограниченное знание того, какие элементы необходимы для построения, в частности центромерных последовательностей. Стоит все же отметить, что проблемы, связанные с центромерными последовательностями, в настоящее время начали преодолеваться.
Author:  Юрий Денисов [ 01 Mar 2021 22:23 ]
Post subject:  Re: Генетика и ГМО
Интересная статья по теме: https://alex-rozoff.livejournal.com/186524.html
Author:  Upsidesium [ 01 Mar 2021 23:39 ]
Post subject:  Re: Генетика и ГМО
Юрий Денисов wrote:
Интересная статья по теме: https://alex-rozoff.livejournal.com/186524.html

Полнейшая ерунда. Замедление случилось из-за появления на пути исследователей слишком сложных проблем чтобы их можно было решить с наскока. Синтез фрагментов нуклеиновых кислот и их внедрение в геном как раз неплохая иллюстрация. Это происходит не только в области молекулярной биологии. Тут требуется последовательное развитие технологий и понимания механизмов, которые сложны и часто не очевидны.
Автор еще и противоречит самому себе: говоря о "финансово-экономическом торможении" генной инженерии, он утверждает, что CRISP устарел и ему на смену пришел Prime Editing. При этом так и не сказал почему в этих условиях РЕ не "затормозился" в отличие от CRISP.
Author:  Gilgamesh [ 02 Mar 2021 19:40 ]
Post subject:  Re: Генетика и ГМО
Upsidesium wrote:
Gilgamesh wrote:
А как его делают? Ведь искусственная хромосома должен быть довольно длинной, а собрать его из 20-20 нуклеотидов требует слишком много времени? Или существует другой путь?

В данный момент существуют две общепринятые модели создания искусственных хромосом:
1) Создание минихромосомы путем изменения естественной хромосомы. Это достигается путем усечения естественной хромосомы с последующим введением уникального генетического материала через систему рекомбинации Cre-Lox.
2) Создание новой хромосомы de novo (можно сказать, что синтетической). Но прогресс в отношении образования de novo ИХ пока ограничен, так как многие крупные геномные фрагменты не могут успешно интегрироваться в векторы de novo. Еще одним фактором, ограничивающим формирование вектора de novo, является ограниченное знание того, какие элементы необходимы для построения, в частности центромерных последовательностей. Стоит все же отметить, что проблемы, связанные с центромерными последовательностями, в настоящее время начали преодолеваться.

Не совсем хорошо разбираюсь в эти дела, но все-таки спасибо :)
Author:  Gilgamesh [ 18 Mar 2021 14:27 ]
Post subject:  Re: Генетика и ГМО
У меня вот еще такой вопрос. Допустим что у человека есть некий ген ABC. Скажите пожалуйста, легко ли выделять этот ген из человека? Много денег и время требуется? :)
Author:  Upsidesium [ 18 Mar 2021 23:15 ]
Post subject:  Re: Генетика и ГМО
Gilgamesh wrote:
У меня вот еще такой вопрос. Допустим что у человека есть некий ген ABC. Скажите пожалуйста, легко ли выделять этот ген из человека? Много денег и время требуется? :)

Насчет денег сказать не могу. Сколько времени? Нужно смотреть протокол.
Изоляция ДНК из ядра клетки -> обработка панкреатическими рибонуклеазами -> аффинная хроматография.
Хроматография ведется на фрагменте синтетической РНК, комплиментарной выделяемому гену, иммобилизованной на целлюлозе.
Техника отработана и стандартизирована. Протоколы есть в сети, даже в свободном доступе.
Attachment:
drive-download-20210318T202155Z-001.zip [1.64 MiB]
Downloaded 289 times
Author:  Юрий Денисов [ 21 Mar 2021 10:30 ]
Post subject:  Re: Генетика и ГМО
Эмбрионы мышей в пробирке довели до стадии образования органов
https://nplus1.ru/news/2021/03/20/mice- ... paign=mish
Author:  Ramon [ 22 Mar 2021 10:09 ]
Post subject:  Re: Генетика и ГМО
Юрий Денисов wrote:
Эмбрионы мышей в пробирке довели до стадии образования органов
https://nplus1.ru/news/2021/03/20/mice- ... paign=mish

Хотел скачать саму статью с Натуры, а не читать "желтяк" по ссылке, но оказывается SciHub не работает. Причем причина не в блокировке.
Author:  Volodymyr [ 22 Mar 2021 21:03 ]
Post subject:  Re: Генетика и ГМО
Ramon wrote:
Хотел скачать саму статью с Натуры, а не читать "желтяк" по ссылке, но оказывается SciHub не работает. Причем причина не в блокировке.

У меня https://sci-hub.se/ открывается нормально, но... при попытке открыть оригинальную ссылку (Nature) браузер закрывается - что Мозилла, что Хром. Через sci-hub - ссылка тоже не открывается.
Author:  Ramon [ 23 Mar 2021 13:44 ]
Post subject:  Re: Генетика и ГМО
У меня Хром не закрывается, но выдает пустую страницу.
Attachment:
Безымянный.jpg
Безымянный.jpg [ 65.83 KiB | Viewed 13999 times ]
Author:  Gilgamesh [ 25 Mar 2021 18:27 ]
Post subject:  Re: Генетика и ГМО
Upsidesium wrote:
Gilgamesh wrote:
У меня вот еще такой вопрос. Допустим что у человека есть некий ген ABC. Скажите пожалуйста, легко ли выделять этот ген из человека? Много денег и время требуется? :)

Насчет денег сказать не могу. Сколько времени? Нужно смотреть протокол.
Изоляция ДНК из ядра клетки -> обработка панкреатическими рибонуклеазами -> аффинная хроматография.
Хроматография ведется на фрагменте синтетической РНК, комплиментарной выделяемому гену, иммобилизованной на целлюлозе.
Техника отработана и стандартизирована. Протоколы есть в сети, даже в свободном доступе.
Attachment:
drive-download-20210318T202155Z-001.zip

Спасибо ;)
Author:  antabu [ 18 Apr 2021 17:58 ]
Post subject:  Re: Генетика и ГМО
Биологи впервые вырастили химер человека и обезьяны — организмы развивались в течение 19 дней.
https://meduza.io/feature/2021/04/17/bi ... l_rMbnodyI
Author:  Upsidesium [ 19 Apr 2021 00:40 ]
Post subject:  Re: Генетика и ГМО
antabu wrote:
Биологи впервые вырастили химер человека и обезьяны — организмы развивались в течение 19 дней.

По возможности желательно всегда выкладывать оригинальные исследовательские статьи.
Attachment:
PIIS0092867421003056.pdf [12.75 MiB]
Downloaded 330 times
Author:  Gilgamesh [ 24 Jul 2021 21:27 ]
Post subject:  Re: Генетика и ГМО
Здравствуйте ;)

Насчет генной инженерии у меня есть еще несколько вопросов.

Настолько я знаю система CRISPR/Cas9 сейчас самая продуктивная для того чтоб редактировать генны в животных. А можно ли его с таким же успехом использовать для пересадки генов? Вот например в крысу я хочу пересадить сразу много разных человеческих генов (скажем 30-40), это возможно?

Есть ли соответствующий протокол? Я одну действительно нашел:
«Практическое руководство по редактированию геномов системой CRISPR/Cas9»
http://www.bionet.nsc.ru/vogis/?wpfb_dl=912
Но там в основном речь идет о модификации генома, а меня интересует именно пересадка в животных. Есть ли такой протокол? Или CRISPR/Cas9 можно одинаково использовать и для редактирования генома и для пересадки генов? :)
Page 13 of 14 All times are UTC [ DST ]
Powered by phpBB © 2000, 2002, 2005, 2007 phpBB Group
http://www.phpbb.com/